En Cooking Mama: Bon Appétit! se podrá cocinar más de 60 recetas, siguiendo los pasos y consejos de la chef más experimentada de la consola. Habrá que cortar la cebolla adecuadamente (si se hace los cortes tdeben ser finos) y ojo con los tiempos de cocción que como algo se queme la Mama se va a poner con una furia, y por supuesto, que no se pase el arroz. Habrá que usar el lápiz de Nintendo 3DS para elaborar diversas recetas, que van desde ensaladas, guisos a repostería pura y dura. Si  el jugador demuestra que es el chef que espera de ti la Mama, conseguirá Medallas de Oro por sus platos.

Sin embargo, para ser buen cocinero no basta con dominar la técnica. Para llegar a lo más alto se necesita ese sexto sentido que convierte una simple tortilla de patatas en alta cocina. Por eso en el modo ‘¡Ayuda a Mama!’, se pondrá a prueba la intuición y creatividad del usuario sometiendo sus habilidades y reflejos al estrés de las grandes cocinas gracias a una gran variedad de divertidos minijuegos.

Los grandes platos son obras de las grandes mentes, pero nada sería posible si el chef no cuenta con pinches que estén a su altura. Así que se podrá compartir la pasión por la cocina con los amigos en el modo Download Play (entre dos y cuatro jugadores) usando tan solo un ejemplar del juego. Se podrá competir entre varios en 15 minijuegos desbloqueados desde el principio. Además, también será posible personalizar el juego con objetos exclusivos disponibles a través de SpotPass tras el lanzamiento del juego.