La historia comienza en el puerto de Nueva York y cuenta la historia del esfuerzo de los submarinos aliados contra las fuerzas del Eje en las diferentes zonas de guerra naval que fueron clave en el conflicto. Los jugadores podrán capitanear un amplio y cuidadosamente recreado parque de naves submarinas de la armada de los EE.UU. para enfrentarse a los buques enemigos tanto bajo el agua como en la superficie.